紫外线消毒器+氯胺这两种消毒方式结合可以对所有已知的病原体起到有效的控制作用。以紫外线为主消毒单元的组合式消毒工艺的紫外线消毒设计剂量一般为40 mJ/cm2。这个剂量可以使对紫外线抵抗力较强的肝炎病毒和轮状病毒等病原体达到4个对数以上的灭活。在滤后水中有有机氨或人工增加氨氮的情况下，余氯和加氯量的关系。在紫外线消毒器做主消毒工艺时，加氯量在区前结束能保证管网中的以氯胺为主的余氯。从理论上来说，这部分的加氯量和余氯的比值可达到5：1。也就是说，如果水中的氨氮为0.2mg/L，在阶段的产生的余氯可达到1mg/L。在第二阶段继续加氯就会使余氯含量减少;到了第三阶段才能生成以自由氯为主的余氯。紫外线作为主消毒工艺时，加氯量只要控制在第1区形成以氯胺为主用来维持管网的生物稳定性。这样就大大地减少氯气的用量。大量的研究证明用氯胺的消毒的方法会大量减少消毒副产物的种类和含量和一些嗅味化合物。