紫外线消毒器消毒物理方法，不向水中增加任何物质，没有副作用，这是优于氯化消毒的地方，通常与其它物质联合使用从而达到消毒的目的紫外线对核酸的作用可导致键和链的断裂、股间交联和形成光化产物等，紫外线消毒器主要是通过紫外线对微生物的辐射损伤和破坏核酸的功能使微生物致死。从而改变了DNA 生物活性，使微生物自身不能复制，这种紫外线损伤也是致死性损伤。

　　一般平均照射剂量在300J/m2以上。低于此值，污水紫外线消毒器用在乡村污水消毒中。有可能出现光复活现象，即病菌不能被彻底杀死，当从渠道中流出接受可见光照射后，重新复活，降低了杀菌效果。杀菌效率要求越高，所需的照射剂量越大。影响微生物接受到足够紫外光照射剂量的主要因素是透光率(254nm处)当紫外线消毒器UVC输出强度和照射时间一定时，透光率的变化将造成微生物实际接受剂量的变化。